Wird sie aktiviert, werden alle Lebewesen in Kalos ausgelöscht - die sogenannte Ultimative Waffe, ein 3000 Jahre altes Relikt des Schreckens. X hat das Geheimversteck von Team Flare entdeckt. Nachdem er in das unterirdische Hauptquartier eindringt, dauert es nicht lange, bis es zum Showdown mit Flordelis kommt. Es scheint nur eine Methode zu geben, um dessen grausames Vorhaben aufzuhalten ...